ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट

निष्कर्षण के बिना एक टेम्पलेट के रूप में सीधे रक्त का उपयोग करके लक्ष्य जीन का तेजी से प्रवर्धन।

यह किट मानव जीनोम में सिंगल-कॉपी जीन को कुशलता से बढ़ाने के लिए आनुवंशिक रूप से इंजीनियर एंटी-इनहिबिटर डीएनए पोलीमरेज़ को अपनाती है। इस किट में अच्छी तरह से अनुकूलित बफर सिस्टम पोलीमरेज़ को पीसीआर अवरोधकों के निषेध का दृढ़ता से विरोध करने में मदद करता है, इस प्रकार रक्त और सुसंस्कृत कोशिकाओं को टेम्प्लेट के रूप में उपयोग करके डीएनए को सीधे बढ़ा सकता है। यह उत्पाद संचालित करने में आसान है और इसके लिए डीएनए शुद्धिकरण या नमूना पूर्व उपचार जैसे जटिल चरणों की आवश्यकता नहीं होती है।
यह किट 2×MasterMix के रूप में प्रदान की जाती है, और प्रतिक्रिया केवल रक्त टेम्पलेट और संबंधित डिटेक्शन प्राइमरों को जोड़कर की जा सकती है। यह मनुष्यों, चूहों, सूअरों, मवेशियों और अन्य प्रजातियों जैसे स्तनधारियों की सुसंस्कृत कोशिकाओं पर लागू किया जा सकता है, साथ ही ताजा या 4 ℃ क्रायोप्रेज़र्व्ड संपूर्ण रक्त, थक्कारोधी (EDTA, साइट्रेट, हेपरिन), तरलीकृत रक्त के थक्के और शुष्क रक्त धब्बे Whatman 903 और FTA Elute वाणिज्यिक कार्ड पर संग्रहीत।

बिल्ली। नहीं पैकिंग आकार
4992529 20 μl × 100 आरएक्सएन
4992530 20 μl × 500 आरएक्सएन

वास्तु की बारीकी

प्रायोगिक उदाहरण

सामान्य प्रश्न

उत्पाद टैग

विशेषताएं

सरल और तेज़: नमूना तैयार करने और डीएनए निष्कर्षण के कठिन चरणों की आवश्यकता के बिना, पीसीआर प्रवर्धन सीधे रक्त का उपयोग करके टेम्पलेट के रूप में किया जा सकता है।
उच्च शुद्धता: नमूना पूर्व-उपचार और डीएनए निष्कर्षण चरणों को छोड़ने से नमूनों के क्रॉस-संदूषण से बचने में मदद मिल सकती है।
उच्च थ्रूपुट: बड़े पैमाने पर नमूनों के लिए पीसीआर पहचान 96/384-वेल पीसीआर प्लेटों के साथ किट को मिलाकर की जा सकती है।
मजबूत सार्वभौमिकता: यह किट जटिल माध्यमिक संरचना के साथ उच्च जीसी टुकड़ों या टुकड़ों को कुशलता से बढ़ा सकती है, और प्रवर्धन लंबाई 5 केबी तक हो सकती है।
मजबूत तनाव प्रतिरोध: इस किट को विभिन्न प्रजातियों और विभिन्न तरीकों से संरक्षित रक्त के नमूनों के लिए लागू किया जा सकता है।

अनुप्रयोग

इस किट के पीसीआर उत्पादों में 3′-छोर पर "ए" होता है, जिसे सीधे टीए वेक्टर क्लोनिंग के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है। इस किट का उपयोग जीनोमिक डीएनए अंशों के प्रवर्धन, उच्च-थ्रूपुट आनुवंशिक विश्लेषण और जीनोटाइपिंग (जैसे जीन का पता लगाने) विश्लेषण के लिए किया जा सकता है।

सभी उत्पादों को ODM/OEM के लिए अनुकूलित किया जा सकता है। ब्योरा हेतु,कृपया क्लिक करें अनुकूलित सेवा (ODM/OEM)


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    Experimental Example एक टेम्पलेट के रूप में मानव EDTA एंटीकोआग्यूलेशन का उपयोग करते हुए, विभिन्न जीसी सामग्री वाले 4 जीनों को ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट द्वारा प्रवर्धित किया गया। पीसीआर प्रतिक्रिया प्रणाली 20 μl थी, और 1 μl रक्त का उपयोग टेम्पलेट के रूप में किया गया था।
    एम: टियांजेन मार्कर II; 1: टुकड़ा आकार १०९० बीपी, जीसी सामग्री ६८.१%; 2: टुकड़ा आकार 1915 बीपी, जीसी सामग्री 70.4%; 3: टुकड़ा आकार ४४८ बीपी, जीसी सामग्री ७४.८%; 4: टुकड़ा आकार 1527 बीपी, जीसी सामग्री 61.5%।
    प्रायोगिक परिणाम: ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट ६१.५%-७४.८% की सीमा पर जीसी सामग्री के साथ डीएनए अंशों को प्रभावी ढंग से बढ़ा सकता है, यह सुझाव देता है कि यह उच्च-जीसी अंशों को बढ़ाने में सक्षम है।
    Experimental Example टेम्प्लेट के रूप में मानव EDTA एंटीकोआग्यूलेशन का उपयोग करते हुए, विभिन्न लंबाई वाले 5 जीन (ActB, Prp, DN1.0, Hn2.0 और Hn4.0) को ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट द्वारा प्रवर्धित किया गया। पीसीआर प्रतिक्रिया प्रणाली 20 μl थी, और 1 μl रक्त का उपयोग टेम्पलेट के रूप में किया गया था।
    एम: टियांजेन मार्कर II; 1-3: 3 अलग-अलग रक्त के नमूने; एनटीसी: प्राइमरों के बिना नियंत्रण। प्रायोगिक परिणाम: ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट टुकड़ों को 4 kb तक बढ़ा सकता है, यह सुझाव देता है कि यह लंबे टुकड़ों को बढ़ाने में सक्षम है।
    Experimental Example मानव EDTA एंटीकोआग्यूलेशन को टेम्पलेट के रूप में उपयोग करते हुए, ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट का उपयोग विभिन्न रक्त नमूनों के पीसीआर का पता लगाने के लिए किया गया था। पीसीआर प्रतिक्रिया प्रणाली 20 μl थी, और 1 μl रक्त का उपयोग टेम्पलेट के रूप में किया गया था।
    एम: टियांजेन मार्कर II; 1-9: रक्त की लोडिंग मात्रा क्रमशः 0.1 μl, 0.2 μl, 0.3 μl, 0.4 μl, 1 μl, 2 μl, 3 μl, 4 μl और 5 μl है; एनटीसी: बिना किसी टेम्पलेट के नियंत्रण
    प्रायोगिक परिणाम: ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट में रक्त के लिए मजबूत प्रतिरोध होता है और यह रक्त के नमूनों को 0.1-5 μl की लोडिंग रेंज के साथ बढ़ा सकता है।
    Experimental Example मानव, चूहे, चिकन और अन्य प्रजातियों के रक्त के नमूने विभिन्न उपचारों के साथ टेम्पलेट के रूप में उपयोग किए गए थे। ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट का इस्तेमाल पीआरएनपी (मानव, 750 बीपी), एक्टिन (चूहा, 200 बीपी), और β-एक्टिन (चिकन, 1.0 केबी) को बढ़ाने के लिए किया गया था। पीसीआर प्रतिक्रिया प्रणाली 20 μl थी, और 1 μl रक्त का उपयोग टेम्पलेट के रूप में किया गया था। एम: तियानजेन मार्कर II।
    प्रायोगिक परिणाम: ब्लड डायरेक्ट पीसीआर किट को नमूनों की एक विस्तृत श्रृंखला पर लागू किया जा सकता है, और विभिन्न प्रजातियों के रक्त के नमूनों पर विभिन्न उपचारों के साथ प्रत्यक्ष पीसीआर का पता लगाया जा सकता है।
    प्रश्न: कोई प्रवर्धन बैंड नहीं

    ए-1 टेम्पलेट

    टेम्पलेट में प्रोटीन अशुद्धियाँ या Taq अवरोधक, आदि शामिल हैं ——डीएनए टेम्पलेट को शुद्ध करें, प्रोटीन अशुद्धियों को दूर करें या शुद्धिकरण किट के साथ टेम्पलेट डीएनए निकालें।

    टेम्पलेट का विकृतीकरण पूर्ण नहीं है ——विकृतीकरण तापमान को उचित रूप से बढ़ाएं और विकृतीकरण समय को लंबा करें।

    टेम्प्लेट डिग्रेडेशन ——टेम्पलेट को फिर से तैयार करें।

    ए-2 प्राइमर

    ■ प्राइमरों की खराब गुणवत्ता ——प्राइमर को फिर से संश्लेषित करें।

    प्राइमर डिग्रेडेशन ——उच्च सांद्रता वाले प्राइमरों को परिरक्षण के लिए छोटी मात्रा में विभाज्य करें। एकाधिक ठंड और विगलन या लंबे समय तक 4 डिग्री सेल्सियस क्रायोप्रेज़र्व्ड से बचें।

    प्राइमरों का अनुचित डिज़ाइन (उदाहरण के लिए प्राइमर की लंबाई पर्याप्त नहीं है, प्राइमरों के बीच डिमर का गठन, आदि) -रीडिज़ाइन प्राइमर (प्राइमर डिमर और सेकेंडरी स्ट्रक्चर के गठन से बचें)

    ए-3 मिलीग्राम2+एकाग्रता

    एमजी2+ एकाग्रता बहुत कम है —— उचित रूप से Mg . बढ़ाएँ2+ एकाग्रता: Mg . का अनुकूलन करें2+ इष्टतम Mg . निर्धारित करने के लिए 0.5 मिमी के अंतराल के साथ 1 मिमी से 3 मिमी तक प्रतिक्रियाओं की एक श्रृंखला द्वारा एकाग्रता2+ प्रत्येक टेम्पलेट और प्राइमर के लिए एकाग्रता।

    ए -4 एनीलिंग तापमान

    उच्च एनीलिंग तापमान प्राइमर और टेम्पलेट के बंधन को प्रभावित करता है। ——एनीलिंग तापमान को कम करें और 2 डिग्री सेल्सियस की ढाल के साथ स्थिति को अनुकूलित करें।

    ए-5 विस्तार समय

    ■ लघु विस्तार समय——विस्तार समय बढ़ाएँ।

    प्रश्न: झूठी सकारात्मक

    घटना: नकारात्मक नमूने लक्ष्य अनुक्रम बैंड भी दिखाते हैं।

    ए-1 पीसीआर का संदूषण

    लक्ष्य अनुक्रम या प्रवर्धन उत्पादों का क्रॉस संदूषण ——ध्यान से नकारात्मक नमूने में लक्ष्य अनुक्रम वाले नमूने को पिपेट न करें या उन्हें अपकेंद्रित्र ट्यूब से बाहर न फैलाएं। मौजूदा न्यूक्लिक एसिड को खत्म करने के लिए अभिकर्मकों या उपकरणों को ऑटोक्लेव किया जाना चाहिए, और संदूषण के अस्तित्व को नकारात्मक नियंत्रण प्रयोगों के माध्यम से निर्धारित किया जाना चाहिए।

    अभिकर्मक संदूषण ——अभिकर्मकों को विभाज्य करें और कम तापमान पर स्टोर करें।

    ए-2 प्राइमr

    एमजी2+ एकाग्रता बहुत कम है —— उचित रूप से Mg . बढ़ाएँ2+ एकाग्रता: Mg . का अनुकूलन करें2+ इष्टतम Mg . निर्धारित करने के लिए 0.5 मिमी के अंतराल के साथ 1 मिमी से 3 मिमी तक प्रतिक्रियाओं की एक श्रृंखला द्वारा एकाग्रता2+ प्रत्येक टेम्पलेट और प्राइमर के लिए एकाग्रता।

    अनुचित प्राइमर डिज़ाइन, और लक्ष्य अनुक्रम में गैर-लक्षित अनुक्रम के साथ समरूपता है। —— प्राइमरों को फिर से डिजाइन करें।

    प्रश्न: गैर-विशिष्ट प्रवर्धन

    घटना: पीसीआर प्रवर्धन बैंड अपेक्षित आकार के साथ असंगत होते हैं, या तो बड़े या छोटे, या कभी-कभी दोनों विशिष्ट प्रवर्धन बैंड और गैर-विशिष्ट प्रवर्धन बैंड होते हैं।

    ए-1 प्राइमर

    ■ खराब प्राइमर विशिष्टता

    —— प्राइमर को फिर से डिजाइन करें।

    प्राइमर की सघनता बहुत अधिक है ——विकृतीकरण तापमान को ठीक से बढ़ाएँ और विकृतीकरण समय को लम्बा करें।

    ए-2 मिलीग्राम2+ एकाग्रता

    एमजी2+ एकाग्रता बहुत अधिक है ——Mg2+ सांद्रता को ठीक से कम करें: Mg . को ऑप्टिमाइज़ करें2+ इष्टतम Mg . निर्धारित करने के लिए 0.5 मिमी के अंतराल के साथ 1 मिमी से 3 मिमी तक प्रतिक्रियाओं की एक श्रृंखला द्वारा एकाग्रता2+ प्रत्येक टेम्पलेट और प्राइमर के लिए एकाग्रता।

    ए-3 थर्मोस्टेबल पोलीमरेज़

    अत्यधिक एंजाइम मात्रा - 0.5 यू के अंतराल पर एंजाइम की मात्रा को उचित रूप से कम करें।

    ए -4 एनीलिंग तापमान

    एनीलिंग तापमान बहुत कम है - एनीलिंग तापमान को उचित रूप से बढ़ाएं या दो-चरण एनीलिंग विधि अपनाएं

    ए-5 पीसीआर चक्र

    बहुत अधिक पीसीआर चक्र ——पीसीआर चक्रों की संख्या कम करें।

    प्रश्न: पैची या स्मीयर बैंड

    ए-1 प्राइमर——खराब विशिष्टता ——प्राइमर को फिर से डिज़ाइन करें, इसकी विशिष्टता बढ़ाने के लिए प्राइमर की स्थिति और लंबाई बदलें; या नेस्टेड पीसीआर करें।

    A-2 टेम्प्लेट डीएनए

    ——टेम्पलेट शुद्ध नहीं है ——टेम्पलेट को शुद्ध करें या शुद्धिकरण किट से डीएनए निकालें।

    ए-3 मिलीग्राम2+ एकाग्रता

    ——एमजी2+ एकाग्रता बहुत अधिक है ——Mg . को ठीक से कम करें2+ एकाग्रता: Mg . का अनुकूलन करें2+ इष्टतम Mg . निर्धारित करने के लिए 0.5 मिमी के अंतराल के साथ 1 मिमी से 3 मिमी तक प्रतिक्रियाओं की एक श्रृंखला द्वारा एकाग्रता2+ प्रत्येक टेम्पलेट और प्राइमर के लिए एकाग्रता।

    ए-4 डीएनटीपी

    ——dNTPs की सांद्रता बहुत अधिक है ——dNTP की सांद्रता को उचित रूप से कम करें

    ए -5 एनीलिंग तापमान

    ——बहुत कम एनीलिंग तापमान ——एनीलिंग तापमान को उचित रूप से बढ़ाएं

    ए-6 चक्र

    ——बहुत सारे चक्र ——चक्र संख्या को अनुकूलित करें

    प्रश्न: ५० μl पीसीआर प्रतिक्रिया प्रणाली में कितना टेम्पलेट डीएनए जोड़ा जाना चाहिए?
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    प्रश्न: लंबे टुकड़ों को कैसे बढ़ाया जाए?

    पहला कदम उपयुक्त पोलीमरेज़ चुनना है। नियमित टाक पोलीमरेज़ 3'-5' एक्सोन्यूक्लिज़ गतिविधि की कमी के कारण प्रूफरीड नहीं कर सकता है, और बेमेल टुकड़ों की विस्तार दक्षता को बहुत कम कर देगा। इसलिए, नियमित टाक पोलीमरेज़ 5 केबी से बड़े लक्ष्य अंशों को प्रभावी ढंग से नहीं बढ़ा सकता है। विस्तार दक्षता में सुधार और लंबे टुकड़े के प्रवर्धन की जरूरतों को पूरा करने के लिए विशेष संशोधन या अन्य उच्च निष्ठा पोलीमरेज़ के साथ टाक पोलीमरेज़ का चयन किया जाना चाहिए। इसके अलावा, लंबे टुकड़ों के प्रवर्धन के लिए भी प्राइमर डिजाइन, विकृतीकरण समय, विस्तार समय, बफर पीएच, आदि के अनुरूप समायोजन की आवश्यकता होती है। आमतौर पर, 18-24 बीपी वाले प्राइमर बेहतर उपज दे सकते हैं। टेम्पलेट क्षति को रोकने के लिए, ९४ डिग्री सेल्सियस पर विकृतीकरण का समय प्रति चक्र ३० सेकंड या उससे कम होना चाहिए, और प्रवर्धन से पहले तापमान को ९४ डिग्री सेल्सियस तक बढ़ाने का समय १ मिनट से कम होना चाहिए। इसके अलावा, विस्तार तापमान को लगभग 68 डिग्री सेल्सियस पर सेट करना और 1 केबी/मिनट की दर के अनुसार विस्तार समय को डिजाइन करना लंबे टुकड़ों के प्रभावी प्रवर्धन को सुनिश्चित कर सकता है।

    प्रश्न: पीसीआर की प्रवर्धन निष्ठा में सुधार कैसे करें?

    उच्च निष्ठा के साथ विभिन्न डीएनए पोलीमरेज़ का उपयोग करके पीसीआर प्रवर्धन की त्रुटि दर को कम किया जा सकता है। अब तक पाए गए सभी टाक डीएनए पोलीमरेज़ में, पीएफयू एंजाइम की त्रुटि दर सबसे कम और उच्चतम निष्ठा है (संलग्न तालिका देखें)। एंजाइम चयन के अलावा, शोधकर्ता प्रतिक्रिया की स्थिति को अनुकूलित करके पीसीआर उत्परिवर्तन दर को और कम कर सकते हैं, जिसमें बफर संरचना का अनुकूलन, थर्मोस्टेबल पोलीमरेज़ की एकाग्रता और पीसीआर चक्र संख्या का अनुकूलन शामिल है।

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